当宣教会について、「統一教会系である」「教義が統一教会に由来する」など、統一教会（または統一協会、正式名称は世界平和統一家庭連合（旧　世界基督教統一神霊協会））との関連性を窺わせる表記や発言が存在しておりますが、当宣教会は、統一教会（統一協会）とは一切関係ありません。

(2022.08.10 追記)
鄭明析牧師は元々キリスト教長老派の教会に所属して日曜学校の教師や教会の執事等を務め、修道生活の中で聖書を繰り返し読み、御言葉をまとめた後、韓国中のさまざまな宗教を見て回る中で、1974年11月から1975年にかけて統一教会（統一協会）を訪れたことがあったことは事実です。
ただし、鄭明析牧師は、統一教会を訪れる前の1973年までには当宣教会の教義となる御言葉を体系化しており、さらには、キリスト教メソジスト派のウェスレー神学校を出て牧師按手も受けており、鄭明析牧師が伝える御言葉が統一教会（統一協会）の教義に由来するとの風説は非論理的です。